İstanbul başsavcılığı tarafından hazırlanan 578 sayfalık iddianamede, Barış Boyun’un çıkar amaçlı silahlı suç örgütü kurduğu ve elebaşı olduğu belirtilmektedir. Örgüt kurma suçundan hakkında yakalama kararı bulunan Boyun’un, örgüt yöneticilerine suç işleme kastıyla talimatlar verdiği ifade edilmiştir. Ayrıca, çetenin emniyet içerisinden bilgi aldığı da ortaya çıkmıştır.
Barış Boyun’un suç örgütü içerisinde bulunan F.A, savcılık ifadesinde, Boyun ile cezaevinde tanıştığını ve parasız kaldığı için Boyun’a ulaştığını belirtmiştir. F.A, çetenin silah ve uyuşturucu ticaretine şahit olduğunu ve çay ocağı bulunan abisi Zafer Boyun aracılığıyla tanıştığını anlatmıştır. Operasyon öncesinde çetenin eline geçen bir liste ile emniyetin yapacağı operasyon hakkında bilgi aldığı belirtilen ifadesi, dikkat çekicidir.
Bilgi sızdıktan sonra örgüt yöneticilerinden Fikri Fatih Çançin ve Tolga Gültepe’nin yurt dışına kaçtığı ifade edilirken, F.A’nın da operasyon sonrasında gözaltına alındığı bilgisi paylaşılmıştır. İddianamede çete lideri Barış Boyun’un şoförü konumunda olan bir polisle işbirliği yaptığı ve kaçması konusunda yardım aldığı da belirtilmiştir.
Gizli tanıkların ifadelerine göre, çetenin yapılanması ve yıllar içinde nasıl büyüdüğü detaylı bir şekilde ortaya konmuştur. Kızılelma, Pamuk, Cüzzam ve Kırık kod isimli gizli tanıklar, çetenin iç işleyişi hakkında savcıya bilgi vermişlerdir. Özellikle Bahadır Akdağ’ın firari durumda olduğunu ve İstanbul’da yaşadığını belirten tanıkların ifadesi, çetenin iç yüzünü aydınlatmaktadır.
Kızılelma kod isimli gizli tanık, örgüt yöneticisi konumundaki Bahadır Akdağ’ın kaçmamak için polis ile işbirliği yaptığını ve polisin kuryelik görevini üstlendiğini ifade etmiştir. Bu polisin hangi karakolda görev yaptığını bilemediğini belirten tanık, para karşılığında Akdağ’a yardım ettiğini de paylaşmıştır. Gizli tanık ifadeleri, çetenin nasıl işlediği ve nasıl örgütlendiği hakkında önemli ipuçları sunmaktadır.